Какие типы взаимодействий возникают между фрагментами полипептидной цепи при формировании третичной структуры
Какие типы взаимодействий возникают между фрагментами полипептидной цепи при формировании третичной структуры: (NH2)-циз-аланин-тирозин-циз-изолейцин-глутамин-(OH)?
Cherepashka_Nindzya 44
Когда полипептидная цепь формирует третичную структуру, возникают несколько типов взаимодействий между ее фрагментами. Давайте разберем каждый из них подробнее:1. Гидрофобное взаимодействие:
Гидрофобное взаимодействие происходит между гидрофобными (неполярными) аминокислотными остатками. В данной цепи фрагменты циз-аланин, циз-изолейцин и глутамин являются гидрофобными. Они вступают во взаимодействие друг с другом, чтобы минимизировать контакт с водой.
2. Гидрофильное взаимодействие:
Гидрофильное взаимодействие происходит между гидрофильными (полярными) аминокислотными остатками. В данной цепи фрагмент тирозин является гидрофильным. Он может образовать взаимодействие с окружающей средой, водой и другими полярными группами в цепи.
3. Водородная связь:
Водородная связь возникает между двумя атомами, один из которых является донором водородной связи, а другой - акцептором. В данной цепи могут возникать водородные связи между различными аминокислотными остатками. Например, тирозин может образовывать водородные связи с глутамином или аланином.
4. Ионные связи:
Ионные связи возникают между положительными и отрицательными зарядами аминокислотных остатков. В данной цепи такие связи могут возникать, если встречаются ионы аминокислот с разными зарядами.
5. Взаимодействие С-концевой группы и N-концевой группы:
Такие взаимодействия могут происходить между С-концевой и N-концевой группами полипептидной цепи. В данной цепи с N-концевой группой взаимодействуют NH2-группа и присутствующие заряды ионов. С-концевая группа также может образовывать взаимодействие с окружающими аминокислотными остатками.
Все эти типы взаимодействий совместно определяют третичную структуру полипептидной цепи. Они позволяют цепи принимать определенную пространственную конформацию, что играет важную роль в ее функции. Благодаря этим взаимодействиям полипептидная цепь приобретает свою третичную структуру в виде сложных складок или спиралей.